В отделение госпитализируются пациенты в возрасте от 1 месяца до 18 лет с острыми кишечными инфекциями (шигелезы, сальмонелезы, эшерихиозы, иерсиниозы, вирусные диареи (ротавирусная, аденовирусная, энтеровирусная и др.), кишечные инфекции неуточненной этиологии и другие заболевания, смешанные с острыми кишечными инфекциями), а также дети с острыми гепатитами. Ежегодно в отделении получают лечение и обследование около 3500 пациентов.

Отработана тактика обследования пациентов, поступивших в отделение: в течение первых часов проводится исследование кислотно-щелочного состояния для определения необходимости проведения инфузионной терапии и состава инфузионных сред.

При поступлении пациентов в первые часы проводится забор общеклинических анализов крови, мочи и кала, бактериологическое и вирусологическое обследование пациентов с кишечной инфекцией, а также серологическое, биохимическое, коагулогическое исследование при подозрении на острый гепатит. В дальнейшем для каждого пациента составляется индивидуальная программа лечения и дальнейшего обследования.

Дети до 4 лет госпитализируются в отделение с обязательным родительским присутствием. Размещение детей в палатах осуществляется в соответствии со сроками госпитализации и нозологическими формами.

Отделение является клинической базой кафедры детских инфекционных болезней РНИМУ имени Н. И. Пирогова. Сотрудники кафедры (профессор Шамшева О. В., доцент Гусева Н. А., доцент Конев В. А., доцент Новосад Е. В., доцент Зверева Н. Н.) оказывают консультативную помощь в сложных диагностических случаях, еженедельно проводят консилиумы.